Zespołami przyrodniczo-krajobrazowymi są fragmenty krajobrazu naturalnego i kulturowego zasługujące na ochronę ze względu na ich walory widokowe lub estetyczne.

W zasięgu terytorialnym Nadleśnictwa Spychowo znajdują się fragmenty dwóch zespołów przyrodniczo - krajobrazowych. Są to:

Rzeka Babant i Jezioro Białe- utworzony został na podstawie rozporządzenia Wojewody Warmińsko-Mazurskiego Nr 26 z dnia 9 sierpnia 2007 r. (Dz. Urz. Woj. Warmińsko-Mazurskiego nr 122 poz. 1700 z 2007 r. Zespół o powierzchni 12 458 ha położony jest na obszarze gmin: Piecki, Sorkwity, Dźwierzuty, Świętajno i Biskupiec. Obejmuje środkową część dorzecza Krutyni w tym zlewnię rzeki Babant wraz z jeziorami: Białe, Gant, Tejsowo, Krawno, Krawienko, Kały, Babięty Wielkie, Babięty Małe, Słupek, Miętkie i Stromek. Celem ochrony zespołu przyrodniczo-krajobrazowego jest zachowanie walorów przyrodniczych i krajobrazowych terenów polodowcowych o zróżnicowanej rzeźbie i o szczególnych wartościach kulturowych. W zasięgu Nadleśnictwa Spychowo zespół zajmuje 561 ha, w tym na gruntach zarządzanych przez Nadleśnictwo 524,72 ha.

Zyzdrój- Zespół przyrodniczo-krajobrazowy „Zyzdrój” utworzony został na podstawie rozporządzenia Wojewody Warmińsko-Mazurskiego Nr 24 z dnia 9 sierpnia 2007 r. (Dz. Urz. Woj. Warmińsko-Mazurskiego nr 122 poz. 1698 z 2007 r.). Zespół o powierzchni 1 335 ha, położony jest w gminach Piecki i Świętajno. Obejmuje środkową część dorzecza Krutyni wraz z jeziorami Zyzdrój Wielki i Zyzdrój Mały. Celem ochrony zespołu przyrodniczokrajobrazowego jest zachowanie walorów przyrodniczych i krajobrazowych terenów polodowcowych o zróżnicowanej rzeźbie i o szczególnych wartościach kulturowych. W zasięgu Nadleśnictwa Spychowo zespół zajmuje 727 ha, w tym na gruntach zarządzanych przez Nadleśnictwo 538,04 ha.